MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 30938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021881	AAG	2	6	242005	242010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464235
5002	NC_021881	A	6	6	242040	242045	100 %	0 %	0 %	0 %	526464235
5003	NC_021881	GA	3	6	242128	242133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021881	AATA	2	8	242177	242184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021881	CTG	2	6	242279	242284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_021881	TACTA	2	10	242314	242323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_021881	GCT	2	6	242392	242397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021881	CAG	2	6	242402	242407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021881	TCTT	2	8	242440	242447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_021881	TCT	2	6	242482	242487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021881	CAG	2	6	242502	242507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_021881	TCT	2	6	242543	242548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464236
5013	NC_021881	TTC	2	6	242609	242614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464236
5014	NC_021881	CA	3	6	242668	242673	50 %	0 %	0 %	50 %	526464236
5015	NC_021881	GA	3	6	242770	242775	50 %	0 %	50 %	0 %	526464236
5016	NC_021881	GCA	2	6	242825	242830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464236
5017	NC_021881	CTA	2	6	242843	242848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464236
5018	NC_021881	AGC	2	6	242889	242894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464236
5019	NC_021881	GAG	2	6	242897	242902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464236
5020	NC_021881	AGG	2	6	242982	242987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464236
5021	NC_021881	GCA	2	6	243088	243093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464236
5022	NC_021881	T	6	6	243112	243117	0 %	100 %	0 %	0 %	526464236
5023	NC_021881	CTG	2	6	243178	243183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464236
5024	NC_021881	AT	3	6	243200	243205	50 %	50 %	0 %	0 %	526464236
5025	NC_021881	GA	3	6	243268	243273	50 %	0 %	50 %	0 %	526464236
5026	NC_021881	TCT	2	6	243280	243285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464236
5027	NC_021881	ACA	2	6	243301	243306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464236
5028	NC_021881	CAT	2	6	243368	243373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464236
5029	NC_021881	GA	3	6	243402	243407	50 %	0 %	50 %	0 %	526464236
5030	NC_021881	CA	3	6	243547	243552	50 %	0 %	0 %	50 %	526464236
5031	NC_021881	GTA	2	6	243556	243561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464236
5032	NC_021881	ACC	2	6	243564	243569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464236
5033	NC_021881	TGC	2	6	243570	243575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464236
5034	NC_021881	CTC	2	6	243614	243619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464236
5035	NC_021881	GCT	2	6	243706	243711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464236
5036	NC_021881	A	7	7	243723	243729	100 %	0 %	0 %	0 %	526464236
5037	NC_021881	GAT	2	6	243804	243809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464236
5038	NC_021881	TATG	2	8	243819	243826	25 %	50 %	25 %	0 %	526464236
5039	NC_021881	ACC	2	6	243849	243854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464236
5040	NC_021881	AG	3	6	243860	243865	50 %	0 %	50 %	0 %	526464236
5041	NC_021881	GTCT	2	8	243871	243878	0 %	50 %	25 %	25 %	526464236
5042	NC_021881	CAA	2	6	243890	243895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464236
5043	NC_021881	ACA	2	6	243907	243912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021881	CA	3	6	243911	243916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_021881	ATT	2	6	243949	243954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464237
5046	NC_021881	TAGCT	2	10	243966	243975	20 %	40 %	20 %	20 %	526464237
5047	NC_021881	TCA	2	6	243989	243994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464237
5048	NC_021881	TAG	2	6	244078	244083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464237
5049	NC_021881	ATTT	2	8	244121	244128	25 %	75 %	0 %	0 %	526464237
5050	NC_021881	T	6	6	244126	244131	0 %	100 %	0 %	0 %	526464237
5051	NC_021881	AGC	2	6	244302	244307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464237
5052	NC_021881	AGA	2	6	244491	244496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464237
5053	NC_021881	TA	3	6	244506	244511	50 %	50 %	0 %	0 %	526464237
5054	NC_021881	CT	3	6	244530	244535	0 %	50 %	0 %	50 %	526464237
5055	NC_021881	CA	3	6	244566	244571	50 %	0 %	0 %	50 %	526464237
5056	NC_021881	ATG	2	6	244653	244658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021881	GTG	2	6	244706	244711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464238
5058	NC_021881	GAG	2	6	244819	244824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464238
5059	NC_021881	GC	3	6	244876	244881	0 %	0 %	50 %	50 %	526464238
5060	NC_021881	GCA	2	6	244898	244903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464238
5061	NC_021881	TGA	2	6	244905	244910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464238
5062	NC_021881	GTG	2	6	245066	245071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464238
5063	NC_021881	AAGT	2	8	245079	245086	50 %	25 %	25 %	0 %	526464238
5064	NC_021881	ATG	2	6	245132	245137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464238
5065	NC_021881	TTA	2	6	245188	245193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464238
5066	NC_021881	AAG	2	6	245213	245218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464238
5067	NC_021881	GTC	2	6	245358	245363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464238
5068	NC_021881	TAG	2	6	245367	245372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464238
5069	NC_021881	GAA	2	6	245424	245429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464238
5070	NC_021881	TGC	2	6	245448	245453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464238
5071	NC_021881	CAG	2	6	245489	245494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464238
5072	NC_021881	ATG	2	6	245522	245527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464238
5073	NC_021881	ATT	2	6	245635	245640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464238
5074	NC_021881	TCT	2	6	245662	245667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464238
5075	NC_021881	GCA	2	6	245971	245976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464238
5076	NC_021881	AAG	2	6	246017	246022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464238
5077	NC_021881	T	7	7	246191	246197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021881	AAT	2	6	246230	246235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021881	TA	3	6	246242	246247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021881	AG	3	6	246274	246279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021881	AAT	2	6	246292	246297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021881	AT	3	6	246310	246315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021881	CGAGGA	2	12	246331	246342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5084	NC_021881	TG	3	6	246400	246405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021881	GGT	2	6	246485	246490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464239
5086	NC_021881	ATT	2	6	246522	246527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464239
5087	NC_021881	TGT	2	6	246581	246586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464239
5088	NC_021881	GCA	2	6	246632	246637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464239
5089	NC_021881	CAG	2	6	246711	246716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464239
5090	NC_021881	TGA	2	6	246718	246723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464239
5091	NC_021881	GAT	2	6	246747	246752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464239
5092	NC_021881	AAG	2	6	246767	246772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464239
5093	NC_021881	AAAG	2	8	246816	246823	75 %	0 %	25 %	0 %	526464239
5094	NC_021881	TTTG	2	8	246828	246835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021881	ACT	2	6	246863	246868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
5096	NC_021881	GCCTAT	2	12	246878	246889	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526464240
5097	NC_021881	TCT	2	6	246890	246895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
5098	NC_021881	TGC	2	6	246972	246977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
5099	NC_021881	CGT	2	6	246984	246989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
5100	NC_021881	T	7	7	247001	247007	0 %	100 %	0 %	0 %	526464240
5101	NC_021881	CAT	2	6	247008	247013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
5102	NC_021881	TTC	2	6	247019	247024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
5103	NC_021881	GTT	2	6	247089	247094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464240
5104	NC_021881	CTA	2	6	247106	247111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
5105	NC_021881	TG	4	8	247112	247119	0 %	50 %	50 %	0 %	526464240
5106	NC_021881	GT	3	6	247143	247148	0 %	50 %	50 %	0 %	526464240
5107	NC_021881	TTG	2	6	247177	247182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464240
5108	NC_021881	TAG	2	6	247190	247195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
5109	NC_021881	ATGCC	2	10	247331	247340	20 %	20 %	20 %	40 %	526464240
5110	NC_021881	AGC	2	6	247393	247398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464240
5111	NC_021881	CCT	2	6	247436	247441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464240
5112	NC_021881	CTG	2	6	247445	247450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
5113	NC_021881	GAACG	2	10	247551	247560	40 %	0 %	40 %	20 %	526464240
5114	NC_021881	CTA	2	6	247564	247569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
5115	NC_021881	T	6	6	247662	247667	0 %	100 %	0 %	0 %	526464240
5116	NC_021881	CTA	2	6	247688	247693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
5117	NC_021881	GTA	2	6	247710	247715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
5118	NC_021881	CTT	2	6	247754	247759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
5119	NC_021881	TA	4	8	247782	247789	50 %	50 %	0 %	0 %	526464240
5120	NC_021881	CAT	2	6	247832	247837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
5121	NC_021881	TCA	2	6	247846	247851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
5122	NC_021881	GAC	2	6	247900	247905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464240
5123	NC_021881	AAG	2	6	247955	247960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464240
5124	NC_021881	GTT	2	6	248039	248044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464240
5125	NC_021881	AAC	2	6	248062	248067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464240
5126	NC_021881	TCT	2	6	248086	248091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
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5129	NC_021881	GCT	2	6	248345	248350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
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5131	NC_021881	TAT	2	6	248427	248432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464240
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5133	NC_021881	TA	3	6	248555	248560	50 %	50 %	0 %	0 %	526464240
5134	NC_021881	TCC	2	6	248590	248595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464240
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5137	NC_021881	ATG	2	6	248722	248727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
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5140	NC_021881	ATC	2	6	248815	248820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
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5142	NC_021881	GT	3	6	249128	249133	0 %	50 %	50 %	0 %	526464240
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5164	NC_021881	TAA	2	6	250355	250360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_021881	TAAC	2	8	250380	250387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5217	NC_021881	GTA	2	6	252816	252821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_021881	T	6	6	253869	253874	0 %	100 %	0 %	0 %	526464243
5233	NC_021881	CCA	2	6	253897	253902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464243
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5237	NC_021881	GAT	2	6	254144	254149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464243
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5242	NC_021881	AGC	2	6	254404	254409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
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5244	NC_021881	TTA	2	6	254448	254453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464243
5245	NC_021881	TAAG	2	8	254524	254531	50 %	25 %	25 %	0 %	526464243
5246	NC_021881	CCT	2	6	254544	254549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464243
5247	NC_021881	CAG	2	6	254590	254595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
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5249	NC_021881	GCA	2	6	254709	254714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
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5371	NC_021881	GTG	2	6	259998	260003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464813
5372	NC_021881	AGA	3	9	260005	260013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464813
5373	NC_021881	A	6	6	260081	260086	100 %	0 %	0 %	0 %	526464813
5374	NC_021881	GGA	2	6	260107	260112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464813
5375	NC_021881	ATG	2	6	260259	260264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464813
5376	NC_021881	GAA	2	6	260330	260335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464813
5377	NC_021881	CTG	2	6	260360	260365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464813
5378	NC_021881	ATG	2	6	260382	260387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464813
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5380	NC_021881	TCT	2	6	260582	260587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464813
5381	NC_021881	TTTTG	2	10	260598	260607	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_021881	TTGTT	2	10	260723	260732	0 %	80 %	20 %	0 %	526464246
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5384	NC_021881	TA	3	6	260785	260790	50 %	50 %	0 %	0 %	526464246
5385	NC_021881	CTG	2	6	260791	260796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464246
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5388	NC_021881	ATG	2	6	260895	260900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464246
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5390	NC_021881	TCCAT	2	10	260963	260972	20 %	40 %	0 %	40 %	526464246
5391	NC_021881	AAG	2	6	260980	260985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464246
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5402	NC_021881	GAAT	2	8	261548	261555	50 %	25 %	25 %	0 %	526464246
5403	NC_021881	AGT	2	6	261561	261566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5405	NC_021881	TGC	2	6	261669	261674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5410	NC_021881	TCGG	2	8	261941	261948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5415	NC_021881	GATA	2	8	262122	262129	50 %	25 %	25 %	0 %	526464247
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5421	NC_021881	AAC	2	6	262381	262386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5422	NC_021881	TAT	2	6	262440	262445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5423	NC_021881	ATT	2	6	262456	262461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5424	NC_021881	T	6	6	262470	262475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5425	NC_021881	AT	3	6	262491	262496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5470	NC_021881	CTT	2	6	264997	265002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5471	NC_021881	CAT	2	6	265092	265097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
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5478	NC_021881	TCC	2	6	265322	265327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464815
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5481	NC_021881	CAT	2	6	265473	265478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
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5483	NC_021881	GCT	2	6	265525	265530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464815
5484	NC_021881	A	6	6	265540	265545	100 %	0 %	0 %	0 %	526464815
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5490	NC_021881	CAT	2	6	265957	265962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464815
5491	NC_021881	TC	3	6	265985	265990	0 %	50 %	0 %	50 %	526464815
5492	NC_021881	ACGC	2	8	266004	266011	25 %	0 %	25 %	50 %	526464815
5493	NC_021881	AGT	2	6	266019	266024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464815
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5497	NC_021881	ACA	2	6	266194	266199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5498	NC_021881	CA	4	8	266198	266205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5499	NC_021881	A	6	6	266208	266213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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